木质托盘熏蒸现在主要有两种处理方法：热处理和用溴甲烷熏蒸。
对于热处理，木质包装箱处理时，其木材中心温度应达到56OC，并且至少保持30分钟。
对于熏蒸，木质包装必须在密闭地方，于规定的溴甲烷剂量下熏蒸至少16小时，然后置于通风处，使其熏蒸剂的浓度降到安全浓度以下。
在上面任何一种处理后，在济南木包装箱包装每件商品的可视位置上，最好是在每件商品的正反两面，标上一个清晰和永久的标记，此标记需要受到国际植物保护公约的认可，以证明木质包装进行了规定的处理。一个标记必须包括IPPC专用标志，ISO标准的国家代码，由该国植物保护机构颁发给木质包装生产商的唯一性的数字，和代表处理方法的字母缩写。免熏蒸托盘产品一般符合世界各国的入境和环保要求，无需任何手续便可以直接在进口国通关。
免熏蒸木质托盘(消毒)方式，有使用药物和热处理两种方式，使用药物为：溴甲烷、环氧乙烷
1、把要熏蒸木箱的货物堆码整齐，用苫布盖好，四边压实，使之密封，但要留出一角做投药口。
2、在苫布下、货物旁放一盆清水，把药投入水中
3、把预留的投药口压实，使需要熏蒸木箱的货物处于完全密封状态下保持24小时
4、打开苫布通风，待毒气散尽即可移动货物，大概18-24小时
5. 开出免熏蒸木箱(消毒)证书。
